[Mon Aug 29 18:02:50 2016] >Input file: TME9V0G2M1G.pdb >TM segments: 321-328_ 332-348_ 360-379 MAIDEN score = 11.5129 Below is the ranking list of the residue pairs and their related pseudo-energy (the lower, the better). This includes inter-chain residue pairs. The maximum (least favorable) pairwise energy value has been set to 10. See the MAIDEN software article: Postic,G., Ghouzam,Y. and Gelly,J.C. (2015) Biochimie, 115, 155–161. ----------- ---------------- Calpha pair Empirical energy ----------- ---------------- M373 -I379 3.45568262449427 I325 -W368 2.34488742756684 I324 -L367 1.23103601439665 L347 -V360 1.12338312737559 I324 -W368 1.01044434841959 V339 -F375 0.986159297623901 L372 -I379 0.888169858464774 I324 -W366 0.765082194413902 F337 -V370 0.757934659403346 M373 -A378 0.739915580197543 A323 -W366 0.712729635054904 I324 -G365 0.69866190485278 G338 -F375 0.620581162744135 A323 -F369 0.595790498980056 F337 -F369 0.562166315766318 G327 -F337 0.560064636003832 A323 -L367 0.559465194023751 F337 -G371 0.534929561770566 A348 -L367 0.503390444685079 I325 -L367 0.493744309233331 A348 -V360 0.467637242111057 I325 -F369 0.445407247201221 L347 -P362 0.434882004926372 S328 -F337 0.416315272469962 G346 -V360 0.391886958430085 G326 -W368 0.385316303089663 G327 -V370 0.360969797506186 L321 -A348 0.351829750360024 A348 -S363 0.327387695955759 A323 -G338 0.314941539132093 G322 -G346 0.306882758632824 A344 -L367 0.289283052499155 A323 -S363 0.288294296300501 L321 -A344 0.287113031695214 G326 -F369 0.282601255828633 G327 -F369 0.281049106618945 G322 -L347 0.272167749335504 G326 -V370 0.261297529866108 V339 -G377 0.261212404738156 F337 -G377 0.257618246823665 R340 -A348 0.25334265560352 R332 -M373 0.239184401605428 G346 -L367 0.238018917783973 L321 -G361 0.234325981736048 G338 -G345 0.233831493545243 S328 -L372 0.22963441387035 G327 -N374 0.229223887173178 G326 -E335 0.225410675021314 G345 -V364 0.221405537654371 G338 -W368 0.211222075621885 G327 -W368 0.198003723515474 I324 -T341 0.196847809928665 G345 -G365 0.189819799197037 R340 -W368 0.182310515619443 A344 -S363 0.180692622385359 A336 -G371 0.180430107096263 I325 -W366 0.176835549058563 G322 -A348 0.174203944266705 L321 -G345 0.170454810601758 G345 -W368 0.170276344107118 R340 -V376 0.167404653156364 G327 -A344 0.164609370932312 I325 -T341 0.164274342240726 L347 -G365 0.163725297319278 F369 -N374 0.162119522034315 A344 -G377 0.161636831452177 I324 -V370 0.160969964151079 I325 -G371 0.159131642010401 R340 -A378 0.157635643477654 G338 -G346 0.152387941961777 G322 -L367 0.145400261642878 A323 -R340 0.144519917452367 G338 -A348 0.143395807156201 G345 -F369 0.13992200258873 I334 -L372 0.139107360994209 T341 -G377 0.138783129294975 G326 -R340 0.134044325203855 G327 -R332 0.133808261057271 G326 -G338 0.130599689494691 G322 -G361 0.129753142507091 A323 -V343 0.12676815572751 T341 -G361 0.12621630946017 I325 -A344 0.125973042721857 A323 -P362 0.122768809436236 I324 -A336 0.121617818813597 R340 -G346 0.120441607904143 A336 -W368 0.116287997758968 A336 -G377 0.115917746885252 A336 -L367 0.114554013855901 V339 -V376 0.11367555506558 S328 -V339 0.113485913760209 T341 -V364 0.113086198732465 G327 -G338 0.112404510868305 A323 -W368 0.111955215233005 L347 -W368 0.111196962493067 T341 -V360 0.110873403555727 G322 -V343 0.110855553198765 G322 -A342 0.107243643999901 V370 -G377 0.10718102995355 G326 -M373 0.106937472408405 A342 -G377 0.106714215158029 G322 -F337 0.103694307004968 G327 -I334 0.103340438067315 L321 -V339 0.103209402136254 N374 -I379 0.100756151472702 S328 -I334 0.100162995067613 A323 -G371 0.0999430421944217 I334 -G371 0.0992330480544954 A336 -V376 0.0988266048187914 G345 -S363 0.0971635108996538 E335 -M373 0.0963164220516335 A342 -F369 0.095492886803366 R332 -G338 0.0933156312054659 V343 -L372 0.0920688678868518 V339 -A378 0.0882823840289804 G338 -I379 0.0877438731129006 T341 -G371 0.0874126522393246 L321 -V360 0.0861533581772047 L347 -G361 0.0860234801837372 G327 -L367 0.0857938729143317 G326 -A344 0.0856651178853243 V343 -P362 0.0855044235165869 I325 -G338 0.0846667784169295 E335 -G377 0.081810155578395 L372 -G377 0.0815490961910027 V343 -M373 0.08104363068247 V343 -G377 0.0793235627468016 V339 -L372 0.0756301366386003 L321 -V343 0.0743885228899579 G326 -T341 0.0733318389455491 G326 -G365 0.0730404982749399 G346 -G365 0.0714462389369822 G327 -A336 0.0705025173588822 E335 -I379 0.0701288741844905 A348 -V364 0.0700124566697244 T341 -V370 0.0690573358262128 A342 -G361 0.0684509194228409 T341 -L367 0.0659213176141407 S363 -W368 0.0591287389912294 R340 -G345 0.0590132823141816 A342 -L367 0.0586430092655279 T341 -N374 0.0575995751431231 G361 -W366 0.0570377085322393 F337 -I379 0.0556067709108914 R332 -V376 0.0551654563484631 F333 -M373 0.051879336433255 E335 -F369 0.0491469978619525 G327 -M373 0.0470593532277226 V339 -W368 0.0470449686274108 E335 -N374 0.0467357824917087 T341 -M373 0.0466087624219669 G322 -G338 0.045663816986639 A323 -A342 0.0452793316262298 V370 -I379 0.0452093907534339 A323 -S328 0.0439457298356016 V360 -G365 0.0434682922736886 I324 -A348 0.0432782251446255 V343 -L367 0.0432701542248077 E335 -T341 0.0416401813579625 T341 -W368 0.0407953871423139 G322 -V339 0.0406899831395406 A323 -G346 0.0395927485387642 A323 -G365 0.0392227908734188 I334 -V370 0.0391175526976744 G346 -S363 0.0385306054726309 L321 -G326 0.0380154155606465 A348 -V370 0.0371955141710298 G326 -N374 0.036264398044346 E335 -L372 0.0361300413669801 G322 -R340 0.035892618113099 I334 -V339 0.0354269693985909 P362 -F369 0.0352368040872033 G346 -F369 0.0348236747387749 A323 -L347 0.0327808221737249 G338 -A378 0.0327264213199498 G326 -V364 0.0298446697997141 L321 -R340 0.0295394780558453 G327 -L372 0.0276912323329199 G326 -A348 0.0271513812778084 L321 -V370 0.026625219447183 G322 -T341 0.0265715237013009 V339 -G346 0.0254432265312872 E335 -V376 0.0253289115908601 V343 -G361 0.0237761081677768 I324 -P362 0.0221532454772611 A348 -P362 0.0208955481135096 G327 -T341 0.0205918307380295 W368 -M373 0.0198585039273871 A336 -A344 0.0192244283641325 R332 -F337 0.0187414046788263 I334 -F375 0.0177157596447233 A348 -G361 0.0162006108873083 A323 -G361 0.0160189858772906 A323 -A336 0.0145414648371194 G322 -V364 0.0137304022855496 I334 -V376 0.0128356054383474 F337 -A342 0.0127978453538558 F337 -A378 0.0113117544129366 V370 -F375 0.0107871672186142 A344 -M373 0.00988502402383507 L321 -G338 0.00959740887529392 R332 -G371 0.00948043184481612 V364 -F369 0.00650999309095956 L321 -F337 0.00506214994439791 V339 -I379 0.00483937629845066 A344 -G371 0.00465436643789729 G327 -F375 0.00386852794694947 A344 -G365 0.00333166703437193 A323 -V339 0.00253421321591141 A344 -V370 0.00158147910004747 I325 -A348 0.000217392332642063 S328 -G377 -0.00064237103786402 V343 -V360 -0.000856709459949867 G326 -L367 -0.00104224186864776 G371 -A378 -0.00192227270501633 A342 -L347 -0.00197142255927374 T341 -L372 -0.0036689262334324 E335 -F375 -0.00372674301882592 A336 -A378 -0.0045040187140355 I324 -F369 -0.00588066437438961 A342 -M373 -0.00599975037713651 V339 -V370 -0.00658932186605421 G338 -M373 -0.00861974815825861 G322 -V360 -0.00927385353679622 A344 -V364 -0.00967078345313599 A344 -L372 -0.0110750108047153 V370 -A378 -0.0110974952451484 V343 -G371 -0.0112474775358407 S328 -E335 -0.0124232267849944 G338 -L367 -0.0126602253266324 G345 -V370 -0.0129013091154828 G327 -R340 -0.0129340161207443 G322 -V370 -0.0179818969066297 G326 -G371 -0.0187158102750966 A342 -G371 -0.0187381847713235 E335 -G371 -0.0188794984123435 G322 -W368 -0.0191741455951959 R340 -F369 -0.0192200942785998 L372 -A378 -0.0195349650979608 V343 -V364 -0.0196755959755555 S328 -F369 -0.0206988157581556 S328 -V376 -0.0221758307571017 S328 -I379 -0.0223291721697745 S328 -T341 -0.0229975237686975 R340 -G371 -0.0233101536578582 S328 -A336 -0.025602118820319 G327 -G371 -0.0258324155444508 L321 -F369 -0.0265911258160392 A342 -V360 -0.0286195691320846 V339 -A344 -0.0314158930031025 A344 -F369 -0.0320592451450921 V339 -L367 -0.0326080898133503 I324 -S363 -0.033516923364147 T341 -F375 -0.0382319146831174 R340 -I379 -0.0394700367226508 V339 -A348 -0.042657321540815 V339 -M373 -0.0429740120896227 T341 -W366 -0.0432278327715798 G327 -I379 -0.0435818452248218 F337 -V376 -0.0467346342272714 A344 -G361 -0.0482289409162897 G346 -V364 -0.0489447159478571 E335 -A378 -0.0490682825557052 G365 -V370 -0.0500055070499643 I334 -N374 -0.0501260933642733 I334 -M373 -0.0502368883419114 I325 -L372 -0.0505400743867437 A342 -V370 -0.051235972009767 R332 -I379 -0.0529728542835628 F369 -G377 -0.0532646623313139 S328 -F375 -0.0549539881303548 F337 -V343 -0.0560158186858071 G327 -F333 -0.0574188322385454 A342 -P362 -0.0577386826095641 G327 -V339 -0.0578615339634032 S328 -A378 -0.0581960568146673 G326 -F337 -0.0605205757807994 F337 -A344 -0.0611220656730804 I324 -A344 -0.0614650651984672 L321 -W366 -0.0639236440424646 G326 -I334 -0.0646942957544407 A323 -F337 -0.0662997655523913 A344 -W366 -0.0667705132877829 P362 -W368 -0.069916069164444 A336 -F369 -0.0700124632831063 F333 -F375 -0.0708048520244868 A348 -F369 -0.0718104766453869 V339 -N374 -0.0722532695883324 A323 -G345 -0.0738382714348429 A348 -W366 -0.0750160904743249 G338 -A344 -0.0762951554245828 R340 -G377 -0.0776161386871441 S328 -R340 -0.08039653691925 I325 -A336 -0.0849174512703641 T341 -A348 -0.0854505920659366 A344 -W368 -0.0857564973557243 F333 -G338 -0.0857799346290768 G371 -I379 -0.0859090600657826 V343 -V370 -0.087181451441795 G327 -W366 -0.0871925394126207 L347 -W366 -0.0875644218515905 I334 -F369 -0.0876268301834695 G326 -V339 -0.0886284408680202 S328 -F333 -0.0889999626887183 F369 -F375 -0.090438891475193 G338 -L372 -0.094482284602837 R340 -L367 -0.0946464648582079 F337 -G345 -0.0966840640150686 I325 -E335 -0.096907989549103 V339 -G371 -0.0970111834939904 I325 -R340 -0.0971067059707398 G322 -S363 -0.0984818119982077 I324 -F337 -0.0990949114611333 I324 -L347 -0.100645058796315 V360 -W366 -0.102649494609502 I324 -G338 -0.102729840210536 T341 -F369 -0.103072289758465 V339 -L347 -0.103311863897767 I325 -G365 -0.103758273957956 G326 -L372 -0.104895194970179 S328 -M373 -0.1049111381211 G345 -W366 -0.105590120997412 I325 -V364 -0.106079575957816 F337 -N374 -0.106549942166932 G322 -F369 -0.108700864143213 G361 -L367 -0.109394525622924 L347 -V370 -0.109998472875599 F333 -N374 -0.112902590069112 A344 -P362 -0.114591723688685 I324 -G345 -0.115288820698174 V339 -G345 -0.115488756499965 A342 -W368 -0.116993024566507 G338 -V376 -0.118328112654833 G326 -A336 -0.119273268260765 G345 -G361 -0.121430556591781 I324 -G371 -0.121924191897324 R340 -N374 -0.128013602440794 A336 -T341 -0.128133455140325 V343 -W368 -0.128148329065668 G322 -G345 -0.128740478413605 G338 -G377 -0.129371631100252 G338 -V370 -0.129494165324431 F333 -G371 -0.130656179629682 G345 -P362 -0.13185950803264 R332 -L372 -0.132218563270266 V343 -F375 -0.132342532570535 A336 -F375 -0.133054086607917 T341 -V376 -0.136582551737454 G345 -V360 -0.137724035438916 A342 -F375 -0.14223136704052 G338 -V343 -0.146634862698954 S328 -G338 -0.147289115884365 E335 -W368 -0.149381191626176 G371 -V376 -0.150865938694578 F337 -L367 -0.151064539479793 A336 -I379 -0.154972544359707 E335 -R340 -0.15674804381427 G338 -G371 -0.157364047034696 A348 -W368 -0.157911528850422 R340 -L347 -0.159082278163879 L347 -F369 -0.159738324892348 A323 -V370 -0.159774093013647 R340 -V370 -0.160411460420724 V343 -W366 -0.163202064567564 L321 -V364 -0.163506876762459 G338 -N374 -0.164119215492282 G371 -G377 -0.165042447931307 A323 -A344 -0.165805444172954 G322 -W366 -0.166946516833598 R332 -G377 -0.168663950867703 F337 -M373 -0.172315679378007 G346 -W368 -0.172562577709062 A336 -N374 -0.176653099452636 I325 -F337 -0.177057071710786 S328 -L367 -0.18028596557966 V343 -F369 -0.182523550716246 A344 -V360 -0.18340909246807 A323 -V364 -0.183927718142169 R332 -A378 -0.188258655935723 P362 -L367 -0.18959122539771 R332 -F375 -0.193554357987674 G361 -W368 -0.193879521075696 G346 -W366 -0.200963959102343 A336 -M373 -0.205522395092921 V360 -L367 -0.205862915354438 R340 -M373 -0.208913782523322 L321 -G346 -0.210989598902852 L321 -A342 -0.218817448713806 L321 -S363 -0.219093610767508 G327 -E335 -0.21940275566859 A323 -T341 -0.220080859369719 A342 -A348 -0.221264855424096 R340 -F375 -0.223078718674042 G326 -W366 -0.224110692072574 S328 -W368 -0.225722141558149 G346 -P362 -0.24016573697832 L321 -W368 -0.24365549710333 A336 -L372 -0.244046835492953 G322 -G365 -0.245141878831784 A336 -V370 -0.250422601900418 G322 -A344 -0.250540790975374 G322 -P362 -0.253442917426142 T341 -P362 -0.265669768729192 G338 -F369 -0.266145216843529 E335 -V370 -0.267483826682078 L321 -P362 -0.270062910835224 R340 -L372 -0.270820260698315 L321 -G365 -0.278629854406425 F337 -F375 -0.282971514014324 V339 -F369 -0.289417655220227 R332 -V370 -0.289634438687638 S328 -V370 -0.291999120493386 L347 -S363 -0.296100427500313 T341 -L347 -0.301707519862314 G345 -L367 -0.303883951047975 A323 -A348 -0.306826905295767 R332 -N374 -0.312049259826717 L347 -V364 -0.31757039193084 L321 -L367 -0.318611161597538 L321 -T341 -0.323351579026394 S328 -N374 -0.325728419121513 F337 -W368 -0.328051104312719 F337 -L372 -0.337161875984627 L347 -L367 -0.33989159221369 T341 -G346 -0.353486638809521 I325 -V370 -0.356045583806015 V343 -A348 -0.376611507192099 G346 -G361 -0.418274404400608 I324 -V364 -0.436737998259148 L321 -L347 -0.446447248613044 A348 -G365 -0.484765612282605 S328 -G371 -0.690767923805165