[Fri Aug 26 17:03:01 2016] >Input file: TMF4WYP9M1D.pdb >TM segments: 370-404_ 414-422_ 452-472 MAIDEN score = 20.5351 Below is the ranking list of the residue pairs and their related pseudo-energy (the lower, the better). This includes inter-chain residue pairs. The maximum (least favorable) pairwise energy value has been set to 10. See the MAIDEN software article: Postic,G., Ghouzam,Y. and Gelly,J.C. (2015) Biochimie, 115, 155–161. ----------- ---------------- Calpha pair Empirical energy ----------- ---------------- R397 -C404 10 D398 -C404 10 L395 -E402 1.74429972275237 V374 -T380 1.19768073007712 D394 -E402 0.886936176756257 A370 -T380 0.779683155670342 V374 -N381 0.640911464422101 A403 -L417 0.626471074205027 A370 -F379 0.568341273675177 L396 -V420 0.565125096861841 F379 -L418 0.530317061511285 D394 -F399 0.491238974221128 G462 -E467 0.490047361476745 P371 -E377 0.452950454305647 P371 -E378 0.452679998910812 E400 -C421 0.42362528182821 A403 -V420 0.419106459770803 L396 -C404 0.408733768740563 D394 -E400 0.407117980954925 P456 -E467 0.392572248675111 K385 -C404 0.390175395646928 P375 -N381 0.385653610740774 E402 -C421 0.383102933993968 D460 -R470 0.351157181060662 V374 -F379 0.346011762796122 V382 -L418 0.345370299413335 L395 -C404 0.329291651577813 R397 -V420 0.325303200285111 E389 -C421 0.325168603501222 F399 -C404 0.321127958900007 P371 -N381 0.319911013243615 L387 -S392 0.313969137933679 G372 -G419 0.312440877195792 D398 -A403 0.309045674492118 A370 -G376 0.30464959778006 C404 -V415 0.297542409443352 L387 -L395 0.296667444783836 V384 -V420 0.278821191088391 G372 -T380 0.272417977676533 A391 -R397 0.261467478747601 G372 -E378 0.254801546363784 E390 -F399 0.245116676481081 A391 -A403 0.243030050278492 L373 -T380 0.237485412427434 L396 -A403 0.23297220749144 D393 -E402 0.22159793612571 E402 -G419 0.21969066497623 D394 -A403 0.217896761608574 P456 -S472 0.210875894222382 V382 -L417 0.206368899636631 F379 -G419 0.201942517913797 E390 -L395 0.199177126408886 L395 -C421 0.19050429012029 E377 -K416 0.185525737196683 A383 -G419 0.184807278064206 T463 -P468 0.184515516867315 P456 -G462 0.184075904874726 D393 -V420 0.182353770290563 L387 -C421 0.181819118406807 M386 -G419 0.178764611199316 R454 -D459 0.176197361983608 N381 -K416 0.171685368510341 C404 -L418 0.169634849464307 T380 -L418 0.15411481810523 V458 -V465 0.152699917439572 K388 -E400 0.150448938224313 A391 -E400 0.149738599335402 A403 -I414 0.14951120861937 L395 -G419 0.147209338935058 L387 -D394 0.144617524088975 E390 -E402 0.143777319628162 K385 -D393 0.141433839690493 E378 -V415 0.14084269969886 N381 -G419 0.136088746862452 E389 -A422 0.135256371073153 A383 -A403 0.132979285192582 V458 -S469 0.131800432142686 K385 -L395 0.128377417133195 S392 -C421 0.127147243068817 G372 -C421 0.12620934039468 K385 -V415 0.125650298378288 D459 -P468 0.124048923587912 L387 -V420 0.121402618479935 T380 -G419 0.120301127918629 E400 -V420 0.118931688320114 A370 -A422 0.114153374710873 V455 -G462 0.112814333250648 V455 -D460 0.111077646217735 D393 -R401 0.110869810808208 A370 -K385 0.110345125973023 L373 -L418 0.110320709059228 V458 -G466 0.110268376300755 L395 -L417 0.109939760349471 V458 -T464 0.109609640510427 R397 -A422 0.108831978481587 K385 -K416 0.108100033843032 P371 -V420 0.108026106834257 V382 -C421 0.106823564358876 E389 -L395 0.104872162035917 S457 -E467 0.104781639099873 K388 -L395 0.103788010982365 A391 -A422 0.100178875775467 D394 -C404 0.098290861687012 L417 -A422 0.0977805322199305 P456 -G461 0.0960143432134062 R397 -E402 0.094803622284934 V465 -L471 0.0946365513010252 L395 -L418 0.0944161863164188 T380 -L417 0.0938382750221631 V384 -L396 0.089723183147369 M386 -L396 0.0894654256862934 A403 -C421 0.0886820142666009 D460 -P468 0.0876595128343747 S392 -D398 0.0866432659375576 R397 -L418 0.0861214654603625 R401 -L417 0.0857515688330314 E402 -L417 0.083976384558978 L387 -R397 0.083042863757872 L387 -R401 0.0829650404502178 A403 -V415 0.0829502006385883 P371 -V384 0.080740399975511 K385 -G419 0.0806997919565959 E389 -E402 0.0803365902259602 P371 -A422 0.0798405425491326 T463 -R470 0.0771636010687967 S392 -G419 0.0768077873440689 M386 -A403 0.076450445507759 V374 -L418 0.0762857677297235 S457 -R470 0.0753843849037055 V458 -E467 0.0753785393044044 M386 -E400 0.0751679362468689 V455 -R470 0.0740625941947668 L396 -L417 0.073742485178812 V458 -L471 0.0736723788907983 A403 -A422 0.0722512012516949 K388 -E402 0.071976527439694 R401 -G419 0.0706902105078253 G372 -N381 0.0683552983927562 C404 -C421 0.0674509002279615 R401 -V420 0.0643527000163462 P371 -G376 0.0629283089906512 A370 -K416 0.0628048248014839 S457 -S469 0.0599974406042869 A383 -C421 0.0578780582990732 A391 -L396 0.056701448238103 E400 -G419 0.0548381339319075 V415 -V420 0.0531990718242028 E377 -L418 0.0524929642958072 G461 -E467 0.0507701206758238 V452 -G461 0.0498653962070648 D394 -V420 0.0481406484278946 V382 -A403 0.0479050683036268 K388 -C421 0.0466327389485759 R397 -G419 0.0442679107628656 D460 -S469 0.0432205369597165 R397 -L417 0.0413224601282227 V452 -P468 0.0390234355636352 G372 -V420 0.0386763379672663 G466 -S472 0.037224037638542 D459 -S469 0.0357813430064389 F379 -I414 0.0340142119749265 S457 -G462 0.0333759616871956 T464 -R470 0.0322418168102805 D393 -F399 0.0317354949353543 E390 -R401 0.0299617769920082 V382 -I414 0.0290373390020378 S392 -C404 0.0275658194168251 V455 -E467 0.0263469116276012 V384 -K416 0.0262465762505065 S457 -P468 0.0256992459096468 K385 -S392 0.0256562808694526 E402 -V415 0.02507158657581 L396 -R401 0.0216716282370739 V382 -A422 0.0180871604897996 P456 -R470 0.0180365487313581 E402 -L418 0.0157246100786517 V384 -L418 0.0145085317364924 E378 -L418 0.013698077069753 A370 -C421 0.0122933085818961 L395 -V415 0.0120840846068533 K385 -V420 0.0118547444435286 G462 -R470 0.0118353337126206 E402 -I414 0.0106487881425856 A391 -V420 0.0106203579838358 G461 -P468 0.0101060591347588 A383 -V420 0.0100156481058076 A370 -V420 0.00934023742943713 A391 -F399 0.00891326385294944 K385 -E390 0.0073733530161868 G461 -L471 0.00300130385500097 V384 -E402 0.00234376767024091 A403 -G419 0.00176990779883335 D460 -G466 -0.00249697350043077 V458 -P468 -0.00478094116592453 L395 -A403 -0.00496932471082701 D394 -G419 -0.00581694821039158 V455 -P468 -0.00948687985738816 V455 -T463 -0.00964133475558571 P371 -G419 -0.0104351118131064 L387 -E400 -0.0116356156353613 M386 -A391 -0.0133645745005293 V384 -A403 -0.0138246152841017 I453 -V458 -0.014003726538288 A391 -C404 -0.0176973857800449 E378 -L417 -0.0179290850719603 D459 -T464 -0.0197249129656938 A391 -C421 -0.0233763730223491 P375 -T380 -0.0237867318722955 V384 -A422 -0.0240352152266974 A370 -V382 -0.024748939564641 V374 -A383 -0.0247751643585117 D459 -E467 -0.0249007518684152 P371 -A383 -0.0250729232829693 N381 -V415 -0.0257971086902904 V458 -T463 -0.0258306424122487 D398 -G419 -0.0259603641258923 T380 -V415 -0.0290963397472495 F379 -V415 -0.029187120547725 F379 -L417 -0.0293814851320269 K385 -E400 -0.0309981134673367 G376 -V382 -0.0327629135903345 L395 -A422 -0.0371060643697332 E389 -D394 -0.0377709002390696 A403 -L418 -0.0382053693549638 S392 -E402 -0.0382399606415693 E389 -F399 -0.0387157917610859 E400 -A422 -0.0393256771737556 P375 -V382 -0.0401665859754545 L387 -L396 -0.0416111475980774 K385 -D394 -0.0416176319953152 M386 -L395 -0.0424425718536234 A403 -K416 -0.043519562411118 L395 -V420 -0.0449404067564707 V455 -S469 -0.0485706452970822 V384 -A391 -0.049995369115166 E378 -G419 -0.0509770578761626 N381 -L417 -0.0515565770789181 I453 -G461 -0.0518024994440718 E402 -K416 -0.0520703719268818 L396 -L418 -0.0526406560272346 F379 -V384 -0.0554709452416531 V384 -L395 -0.0559786276018066 P456 -T463 -0.0568282020521114 E378 -K416 -0.059563351864333 G372 -L417 -0.0599963665141923 M386 -L417 -0.0614040067216242 F379 -K416 -0.0621454138010578 E389 -V420 -0.0625336998946855 L396 -K416 -0.0630705046217219 T380 -K416 -0.0631554757326218 E390 -A403 -0.0642017343003216 G372 -V382 -0.0647449228751888 S392 -A422 -0.0655119841742966 V452 -S457 -0.0655159978086903 I414 -G419 -0.0659501017799746 A370 -L417 -0.0671761092101848 D459 -L471 -0.0675209575398501 E467 -S472 -0.0709753720724886 K385 -R397 -0.0716046136846122 A383 -A422 -0.0775500527257457 A383 -L418 -0.0782895768170029 E378 -V384 -0.0793569894511981 V384 -V415 -0.081584263670895 T463 -L471 -0.0817870181397775 A383 -E402 -0.0843612012599748 S392 -R397 -0.0852807985698385 S457 -L471 -0.0854967108222722 P371 -L418 -0.0857403097621958 P371 -T380 -0.0877368419305754 G462 -L471 -0.0880760536037952 D398 -V420 -0.0886339878055535 D459 -V465 -0.0890786703097328 L387 -E402 -0.0891263201804995 L387 -A403 -0.0898241296164204 E377 -A383 -0.0901773466331584 L396 -C421 -0.0902503397490904 D393 -A422 -0.0909795315346305 A391 -D398 -0.0917824395930289 P456 -L471 -0.0918852049069816 S392 -F399 -0.0919086880000134 A383 -L417 -0.0925817111049003 K388 -V420 -0.0932589413912304 D460 -E467 -0.0936496604482185 I453 -E467 -0.0953222163220842 M386 -L418 -0.0965898103697421 D394 -L417 -0.0969568338352031 R454 -G461 -0.101561789977867 V455 -L471 -0.102713718221339 A370 -G419 -0.102982240236114 K385 -R401 -0.103044618876256 D459 -G466 -0.103071413572136 P456 -S469 -0.103359749952753 N381 -V420 -0.103544132772449 L387 -G419 -0.103937833926041 V382 -V420 -0.105391626848164 G372 -E377 -0.106442199690437 K388 -R401 -0.106606037815627 S392 -R401 -0.107269538853336 R454 -P468 -0.107849595817456 I453 -P468 -0.108622325764207 G462 -S469 -0.108899306980575 V384 -S392 -0.109516932048231 G466 -L471 -0.111037414221964 K388 -D393 -0.111110794632974 D393 -A403 -0.116099352439669 F379 -V420 -0.117434921100978 M386 -A422 -0.118294799868259 G372 -F379 -0.118439031888154 L373 -E378 -0.119656002916805 T380 -V420 -0.121173758381289 G372 -L418 -0.121545498847415 V455 -G461 -0.121653627179737 V452 -T463 -0.121812804884569 G376 -N381 -0.122841737335641 L396 -G419 -0.123899394462016 G461 -G466 -0.124079896865089 K385 -L418 -0.126850768185225 V382 -G419 -0.128090819455363 A391 -E402 -0.12867540184472 C404 -I414 -0.130328585874706 A370 -E378 -0.131182528228216 K388 -R397 -0.131839606604633 C404 -L417 -0.132482871792811 P371 -V382 -0.133045382983056 L395 -K416 -0.135729106726672 D393 -E400 -0.138423913436865 P371 -L417 -0.138621045707976 D394 -A422 -0.139709728542082 A383 -I414 -0.140283997228312 F399 -V420 -0.14038463273526 E389 -R397 -0.146514515207623 V452 -E467 -0.148148921430521 A370 -P375 -0.148633517001218 G461 -S469 -0.148900142891532 M386 -E402 -0.150524984747899 M386 -D393 -0.154850647499741 E390 -L396 -0.157342687448341 E400 -L417 -0.158498383289214 E389 -R401 -0.159133671874393 K388 -A403 -0.159212062448616 E378 -I414 -0.159378037276504 V465 -R470 -0.163346814037945 K388 -D394 -0.164616437002396 E377 -L417 -0.165504577413048 V458 -R470 -0.16577374413034 A383 -L395 -0.165996268106702 A370 -N381 -0.16707572782321 K385 -L417 -0.171674334331808 E389 -E400 -0.171721612951409 K385 -E402 -0.171900989097025 K385 -L396 -0.172877031187711 K388 -L396 -0.173580175406959 E390 -E400 -0.17392640843374 D398 -L417 -0.174675150219298 E390 -R397 -0.175694635359401 S392 -V420 -0.175956721086328 A391 -R401 -0.176188640121859 E377 -V415 -0.177271165856336 P456 -P468 -0.178785651075932 D460 -L471 -0.179990676565714 P371 -C421 -0.181337702539923 L373 -V382 -0.183689079422274 G461 -R470 -0.185416385187062 G462 -P468 -0.189633382220242 M386 -S392 -0.191226914455483 S392 -A403 -0.194897883521706 V384 -G419 -0.197212453227756 M386 -D394 -0.198174868650205 K388 -A422 -0.198634034541084 L373 -F379 -0.19917723075709 D394 -C421 -0.199928815121918 V382 -K416 -0.200789698969223 D393 -D398 -0.202087761094589 A370 -A383 -0.206240532866291 A383 -V415 -0.207551785258423 V384 -D394 -0.20827487788937 E389 -L396 -0.211109864163792 R397 -K416 -0.211337776819118 P371 -F379 -0.212783908591543 M386 -C421 -0.213302612794142 L387 -D393 -0.216197894152438 T463 -S469 -0.224548887740689 T464 -S469 -0.226160378881953 E378 -A383 -0.228727311423567 L396 -E402 -0.234898330112959 A370 -E377 -0.234936529087573 M386 -V420 -0.235912275782226 S392 -E400 -0.237093588093941 L373 -N381 -0.239626819339446 L396 -A422 -0.240588009284309 D398 -C421 -0.243502508184227 N381 -L418 -0.244512262568729 C404 -K416 -0.248607322616223 D459 -R470 -0.248985835797267 E377 -V382 -0.249420862786445 V382 -V415 -0.254198043134286 A370 -L418 -0.265979354828216 D460 -V465 -0.277095477256782 D393 -C404 -0.285772562701224 K385 -A391 -0.291902380133256 A383 -K416 -0.295406728297579 D393 -C421 -0.304886845996848 L387 -A422 -0.305673924160423 M386 -R397 -0.306578471573701 K385 -C421 -0.314880805846122 E402 -V420 -0.31629856616495 C404 -G419 -0.334960630516126 V384 -L417 -0.337224897485292 V374 -V382 -0.339059761940559 K385 -A403 -0.353434594290626 K385 -A422 -0.358675662674161 A370 -V384 -0.366444858616976 C404 -V420 -0.387530215264345 R397 -A403 -0.461183658445801 L395 -R401 -0.512324627817851 V384 -C421 -0.52176043861445 L395 -E400 -0.540116270601721 D394 -R401 -0.57204734065884 R397 -C421 -0.577821680731263