[Fri Aug 26 16:27:29 2016] >Input file: TMH0G195M1D.pdb >TM segments: 356-401_ 427-451 MAIDEN score = -16.8585 Below is the ranking list of the residue pairs and their related pseudo-energy (the lower, the better). This includes inter-chain residue pairs. The maximum (least favorable) pairwise energy value has been set to 10. See the MAIDEN software article: Postic,G., Ghouzam,Y. and Gelly,J.C. (2015) Biochimie, 115, 155–161. ----------- ---------------- Calpha pair Empirical energy ----------- ---------------- A427 -F433 0.60860416855751 M428 -F433 0.577142425652899 V378 -A400 0.485902634983359 I382 -G399 0.445121635959564 I382 -A397 0.42607995720695 Q359 -L364 0.397343512768 I382 -A400 0.382665513256223 M428 -V434 0.340625013356057 G385 -A400 0.323508249991884 G380 -G399 0.310726741865652 L379 -A400 0.306888510492492 W431 -S436 0.301600734916631 G385 -G399 0.299637104515298 L383 -G396 0.270226080730538 L383 -G399 0.268946161529888 A437 -A444 0.261709759056147 A444 -A450 0.261270515391715 F439 -G448 0.246688615434863 L364 -P370 0.246637112737608 A427 -L432 0.230347094605612 F384 -A400 0.228779460889744 F384 -G396 0.228075237205851 V378 -F384 0.212150467646801 Q359 -S366 0.205273759300868 M428 -L438 0.203060428947132 I373 -G380 0.202017871538482 S440 -G447 0.188697974468813 T390 -A397 0.187789118015095 F384 -T390 0.182150686724927 V360 -S366 0.18198950047797 S436 -A444 0.179297110563626 G385 -A394 0.17837185002964 G380 -G396 0.176222256158756 A394 -G399 0.172727264710694 I382 -G396 0.158322635422869 T375 -L383 0.154545932612271 F384 -V395 0.152092307617846 S392 -G399 0.152005485535121 C430 -S440 0.141405428327172 I373 -V378 0.127753285521892 G380 -A398 0.121410843375521 A394 -A400 0.120230642198934 M428 -A437 0.119687703466955 V365 -A372 0.117511436664242 L383 -S392 0.116036749829392 A393 -G399 0.115967251565079 V377 -G399 0.113621338307449 V378 -G385 0.112872825073117 A427 -A437 0.11162631742662 S392 -A400 0.101454924581547 S440 -I445 0.100642544816079 I382 -A398 0.0978456325654102 T387 -G396 0.0965649965134571 L374 -A400 0.0964511770778829 E391 -A398 0.0941513826402822 R357 -L363 0.0926124763548035 L364 -L371 0.0907141962140368 V361 -S366 0.0903145798936524 E356 -L363 0.0895584236366219 A372 -V378 0.0892523461719419 V378 -A397 0.0882300518532678 F443 -G448 0.0881025789117711 P370 -V376 0.0853133445623118 I373 -I382 0.0830988853262422 L358 -V365 0.0828815619381056 T387 -S392 0.0823586288895739 V429 -V434 0.0822844990344329 A441 -A450 0.0786469383633701 A441 -L451 0.0784742854881939 V368 -I373 0.0777463153118971 E356 -K362 0.0729509386590053 R357 -L364 0.0704939677839462 F384 -A398 0.0683823942509227 V434 -F439 0.0678134362476035 T388 -A400 0.0648848333209648 P370 -T375 0.0601113159526658 L379 -I386 0.0599638546869685 T375 -F384 0.0593766889341627 C430 -V442 0.0592152205466441 S440 -A450 0.0585282902452517 V429 -A437 0.0585077026412568 E391 -G396 0.0578750834086257 E391 -G399 0.0560788273114329 V376 -G399 0.0522321880129211 V361 -P370 0.0513045343209679 L364 -M369 0.0510216656508096 A437 -I445 0.0508876987163775 R357 -V365 0.0489840216310102 A437 -L446 0.0482196009017493 L358 -L363 0.045261084873756 T390 -V395 0.0450731094393745 S436 -Q449 0.0435167726587524 I386 -A394 0.0424709884094163 V377 -F401 0.041639435293899 V360 -S367 0.0400669894751835 V360 -V368 0.0389210040722423 G380 -A397 0.0374755034832699 W431 -L438 0.0363304523341936 F384 -E391 0.0352716284522065 L383 -A389 0.0339709696579469 A389 -A398 0.0323934743466889 V361 -I373 0.0310614346512548 F439 -A450 0.0303478312668624 A389 -A397 0.0292525083970228 I386 -A393 0.0291393005215026 L432 -S440 0.028639821961514 L383 -F401 0.0282522532339344 V381 -E391 0.0274946716317068 F439 -L446 0.027358146989434 G385 -E391 0.0271662914438955 F433 -F439 0.0260277541190881 L432 -V442 0.0239613094603348 I386 -V395 0.023353280409627 E356 -L364 0.0225669821235346 L438 -L446 0.0222896006758209 V377 -A397 0.0211409814984345 E356 -V361 0.0175027352830239 G435 -A444 0.0170994522129497 T375 -A397 0.0156373757184767 G385 -A398 0.0154198384207085 V378 -A398 0.0140988863121851 A393 -A398 0.0118117186668649 G380 -I386 0.0116875175619291 L379 -V395 0.0100982266577159 A372 -G380 0.00628148878461432 V377 -F384 0.00611446269267524 T390 -G396 0.00475175120323312 L374 -I382 0.00290474370596971 I386 -G396 0.0014855345918674 L379 -T387 0.000769002256414852 L379 -G396 -0.00148436719440781 L383 -A400 -0.00191865234355992 L379 -A398 -0.00193547331638033 A427 -V434 -0.00400634331140859 V381 -A398 -0.00448049221549951 L358 -S366 -0.00448408059047845 W431 -S440 -0.00572458427190892 L438 -Q449 -0.00617413032722158 I382 -T390 -0.0086908185052037 T388 -A398 -0.0105326467731635 Q359 -V368 -0.0105992623849644 Q359 -S367 -0.0106146223306074 C430 -F439 -0.0130031509863269 V376 -F384 -0.0135506495974171 V442 -A450 -0.0137754673302077 I382 -A394 -0.0142061225268635 I382 -A393 -0.0172926718706528 I382 -S392 -0.0178003540062837 F439 -G447 -0.0184923022062433 V378 -L383 -0.0184974708037409 E356 -S367 -0.0196184834091212 L383 -E391 -0.0203104104103762 F439 -Q449 -0.0230427335680705 V381 -A394 -0.0239528426697491 V376 -A400 -0.024562524420191 G380 -T388 -0.0246501719937737 V361 -A372 -0.025243775555004 C430 -G435 -0.0253281476366777 L383 -T388 -0.0274832770298925 G385 -A393 -0.0275681007727846 C430 -A441 -0.0291127180805251 A372 -L379 -0.0298124734201544 G435 -F443 -0.030036107832534 L438 -G448 -0.0301227082235771 I382 -A389 -0.0319938856963189 S436 -I445 -0.0330484722045077 L432 -L438 -0.0331872807056595 V442 -Q449 -0.0333704173534024 V377 -A400 -0.0387537573156465 V429 -G435 -0.0390387634997476 R357 -K362 -0.0404721648618782 G435 -I445 -0.0408913704519662 L379 -F401 -0.0412964346740514 V442 -L451 -0.0419059253854197 T387 -V395 -0.0450396272865108 G380 -F401 -0.0457264743481369 G385 -F401 -0.0458819884487816 F384 -G399 -0.0494691784333912 E391 -A400 -0.0499917995243944 T375 -G399 -0.0522562765851141 A437 -Q449 -0.0526344157255725 G380 -T387 -0.0552774247544405 T375 -F401 -0.056004929909198 A444 -Q449 -0.0599519648431097 I373 -V381 -0.0628397677152677 R357 -S367 -0.0636628498632397 V381 -F401 -0.0667654739547849 S440 -L451 -0.0682071880978894 T388 -G399 -0.0711688554236551 A441 -G448 -0.072190937126481 V381 -T388 -0.0727733732416063 L374 -F401 -0.0741497748933817 V360 -P370 -0.0769261540890083 V381 -T387 -0.0775651106775976 W431 -A437 -0.0776349076638829 G380 -A400 -0.080663750840579 I386 -A397 -0.0818625640100903 L358 -S367 -0.0834896134794887 V381 -S392 -0.0872494105687402 R357 -S366 -0.087367919237664 V378 -G396 -0.0888533363970128 L379 -T388 -0.090415489625993 L363 -M369 -0.0921384321862495 V365 -I373 -0.0932458536975949 I445 -L451 -0.0954457400746143 L383 -T390 -0.0958356015803293 T388 -A397 -0.0964284446828052 V361 -L371 -0.0964294748356656 M369 -L374 -0.0965813641331221 F433 -S440 -0.097089036394461 T387 -A397 -0.0974016246788993 V381 -V395 -0.0978778123793942 V434 -V442 -0.0978926749863658 K362 -V368 -0.0979374020189141 G380 -G385 -0.0979481540023404 L374 -G380 -0.0996203763529389 E356 -V365 -0.0999061452371848 F384 -A397 -0.102393424771622 V376 -V381 -0.102705707940252 F433 -A441 -0.102727505734784 G385 -G396 -0.103412957614659 V395 -F401 -0.103702916871064 L371 -V378 -0.10415285028254 L438 -G447 -0.106252727223455 F384 -A394 -0.106838293097533 L383 -A398 -0.107319541435523 A437 -F443 -0.109202786135863 T388 -A394 -0.111152747029637 M428 -S436 -0.113694831139653 E391 -A397 -0.115175203602965 V376 -F401 -0.1196703744993 L432 -F439 -0.121166630454279 L374 -L383 -0.1218496687043 F384 -A389 -0.123780648861969 S436 -F443 -0.123802562280965 I382 -T387 -0.12493057594397 T387 -A394 -0.126729602815351 V434 -F443 -0.12746720343959 S366 -L371 -0.127503292229468 L383 -A394 -0.127746197250535 V381 -G396 -0.128517119739321 K362 -S367 -0.129628583547886 G385 -V395 -0.129907644444846 L379 -G385 -0.130674813733331 L432 -A437 -0.131926990262329 V381 -I386 -0.133619319722673 L358 -L364 -0.133626550546758 I382 -F401 -0.134444073457784 F433 -V442 -0.134605257504271 W431 -A441 -0.135409804827076 G435 -V442 -0.136160670542852 V429 -F439 -0.136683003371345 V360 -M369 -0.143487891855777 F384 -A393 -0.144392947912513 K362 -M369 -0.146003000605392 L432 -A441 -0.148011789630097 C430 -S436 -0.148945367837803 A441 -Q449 -0.150416369888799 T375 -A400 -0.150852863748887 T387 -A393 -0.151133457219168 S440 -G448 -0.151981703368973 V434 -S440 -0.152104417397428 F443 -L451 -0.152527795371469 S440 -L446 -0.153786119376073 G396 -F401 -0.154421842371261 I382 -E391 -0.155998941296657 L363 -P370 -0.156244277393744 A427 -L438 -0.157591360928312 F384 -S392 -0.159428730486207 L379 -G399 -0.16035948001495 M428 -G435 -0.16329776512923 L383 -V395 -0.165891258159654 S440 -Q449 -0.17000956650919 K362 -P370 -0.176239681474208 A441 -L446 -0.178528548483914 L371 -V377 -0.183336871005163 A389 -A394 -0.189046880585168 V377 -I382 -0.191004266212355 I386 -S392 -0.192753275987442 A427 -S436 -0.194612090820197 V434 -A441 -0.197734789515042 I386 -E391 -0.198179624458897 T375 -V381 -0.199802108213794 A389 -G396 -0.200891987941505 L438 -F443 -0.201382995993484 S392 -A398 -0.201520145486463 V376 -L383 -0.201820165431446 V381 -G399 -0.203994481352737 V378 -G399 -0.206762451548239 A427 -G435 -0.20746795373184 T388 -G396 -0.208128450449733 G385 -S392 -0.210205948839078 W431 -F439 -0.210361345981591 W431 -V442 -0.212019483606638 L383 -A397 -0.212195281517326 V361 -M369 -0.213054646447393 V365 -L371 -0.215012253677228 V442 -G447 -0.215954349719754 T375 -I382 -0.216492465745504 I445 -A450 -0.216595391137293 F439 -I445 -0.218401818560384 V429 -L438 -0.221191860266715 V442 -G448 -0.22232908910736 T388 -V395 -0.223426915618202 L374 -V381 -0.223548065679549 G385 -T390 -0.226487393599337 L374 -L379 -0.228255894014264 C430 -L438 -0.232391484655203 T375 -G380 -0.233866612999323 G435 -S440 -0.237721718867817 L438 -I445 -0.243271603129267 Q359 -V365 -0.244430074322194 V429 -S436 -0.250299768547195 L379 -A397 -0.251879726841855 G435 -A441 -0.256293056499468 A441 -G447 -0.260444999584632 I382 -T388 -0.261252597281587 V365 -P370 -0.265274249918078 V381 -A397 -0.270113429751858 V360 -V365 -0.271100795186671 A444 -L451 -0.276929002114055 S436 -V442 -0.279556227225676 L371 -V376 -0.286966748807306 F433 -L438 -0.293094567749069 L438 -A444 -0.297466701570992 V378 -F401 -0.298525565231313 S392 -A397 -0.303341876216187 A372 -V377 -0.310027479754111 A437 -V442 -0.313855729507349 I373 -L379 -0.331735554396624 V361 -V368 -0.332120113947336 V361 -S367 -0.336941472700166 V395 -A400 -0.338782640576686 A389 -V395 -0.343944002019918 V377 -L383 -0.346435541237355 T388 -A393 -0.375510851116659 C430 -A437 -0.378787379835262 L379 -F384 -0.386486415557459 L363 -V368 -0.399736851187447 V381 -A400 -0.402265003805509 I382 -V395 -0.403649558922912 F443 -A450 -0.416450135215535 V376 -I382 -0.422581309801908 L446 -L451 -0.440809978773404 F439 -A444 -0.463676094228592 G385 -A397 -0.480870116005052 S436 -A441 -0.540764123673801 F443 -Q449 -0.657779593864311