[Mon Aug 29 17:41:48 2016] >Input file: TMI4ZV66M1G.pdb >TM segments: 370-438 MAIDEN score = -13.5181 Below is the ranking list of the residue pairs and their related pseudo-energy (the lower, the better). This includes inter-chain residue pairs. The maximum (least favorable) pairwise energy value has been set to 10. See the MAIDEN software article: Postic,G., Ghouzam,Y. and Gelly,J.C. (2015) Biochimie, 115, 155–161. ----------- ---------------- Calpha pair Empirical energy ----------- ---------------- C417 -R422 1.206018167087 A390 -K395 0.635181944601324 L372 -V385 0.603568439610345 G373 -V385 0.541241669040367 L372 -V388 0.525700427083264 A376 -F392 0.523455920099982 A414 -V425 0.471522601939641 L372 -N384 0.415532294578632 S416 -I421 0.401302184854074 S416 -R422 0.375696364256234 A376 -G383 0.329621742874566 G382 -A389 0.327021413775024 G377 -A387 0.323695776210283 E431 -Q437 0.323548093904717 G391 -M397 0.323183825839173 G377 -A389 0.312408155222762 G383 -G391 0.303671576184422 A414 -I421 0.295594274446492 R422 -K428 0.291314803581269 C417 -K428 0.289087775211172 M420 -H427 0.277291039888519 G373 -G383 0.276274903164141 G373 -L393 0.269203764343421 V425 -Q432 0.254664449823665 K428 -R433 0.249923669956735 G374 -G386 0.248110859683173 V425 -E431 0.239497438030879 V375 -V385 0.205351219856337 G391 -L398 0.204529899937897 S424 -Q432 0.202948390605851 G391 -D399 0.20018670342607 S424 -K430 0.198264050784874 G377 -N384 0.189065944305976 A390 -D399 0.188689688809972 R422 -H427 0.188498253537184 G374 -N384 0.180720627914948 A415 -K428 0.176254938723044 A381 -A389 0.17291066059337 G380 -A389 0.170302903023166 V411 -V425 0.170063356902122 A376 -G382 0.163599223019451 G373 -G396 0.162345951279136 R433 -A438 0.161233004711367 G373 -L394 0.157268022201976 A376 -G386 0.157262469909473 G373 -K395 0.154241531183413 G373 -A389 0.153981720048403 M406 -V411 0.153813680950781 G396 -Q401 0.152125086344641 I379 -A390 0.150150966179386 G377 -G391 0.146718754114753 D370 -N384 0.146219672034781 A414 -Q437 0.145766981621742 I378 -A387 0.145474539245 A415 -H427 0.139576696173955 A414 -F423 0.136096962808057 L404 -I413 0.134429716321655 A371 -G377 0.134225797206945 N384 -F392 0.133480370425993 V412 -H427 0.133251252199758 A371 -A381 0.13225060482177 V388 -L398 0.128122381814416 A381 -A390 0.125813911513008 I421 -Q432 0.125765813164701 G382 -V388 0.125368629224901 G373 -I379 0.122519930963342 M406 -V412 0.122096005430878 G374 -G391 0.119187753924226 A376 -V385 0.115910873462957 A387 -M397 0.115509200887149 G374 -G380 0.114387903358464 I413 -R433 0.110486287917997 A376 -G396 0.110351807539771 D370 -A387 0.109597269773578 C417 -F435 0.1086419656605 A371 -A387 0.108491889707034 S416 -A438 0.107834324608046 V412 -S424 0.107726727561948 I378 -V388 0.107366483495829 G382 -A390 0.107097982874969 A415 -S424 0.107047795529023 G374 -A390 0.106429344149097 A371 -G386 0.106186965622783 D399 -L404 0.104612018859681 G383 -V388 0.103856376155373 S416 -K428 0.103629253108196 V412 -K430 0.103395889406821 V425 -L434 0.102472746549745 K428 -L434 0.100456133534207 V375 -G383 0.100436592065748 L404 -V411 0.100345937868442 R422 -Q432 0.0998470202553272 S416 -R433 0.0990597069098105 A414 -L419 0.0982428670480171 G386 -G396 0.0961753370077023 G377 -G382 0.0911277507278818 V375 -A387 0.0904351998998435 V412 -R433 0.0867615495853622 A389 -L394 0.0859174521419277 M397 -T403 0.08578825664419 G374 -L393 0.0840250186130502 G373 -G380 0.0784364225441991 F392 -D399 0.0783191835673944 V411 -R433 0.0781834610755827 A381 -V388 0.0771514562665123 V388 -G396 0.075583136841348 A371 -I378 0.0747410003406784 L407 -V412 0.0745131028451027 E431 -E436 0.0744009188475234 V375 -L393 0.0735965998716106 I379 -A387 0.0719528335584254 G373 -A381 0.0708941447049147 L410 -E431 0.0706931731344763 V388 -I400 0.0703465685822535 F423 -Q432 0.069243708313028 L372 -A390 0.0687412227713775 V412 -C417 0.0669343151039687 T403 -V412 0.06648937271388 M420 -E426 0.0662589911063527 V375 -G380 0.0661047981983014 A371 -A390 0.0629574200779643 G377 -V388 0.0626522051423226 A381 -G386 0.0620300727111882 A371 -F392 0.0619282780445878 V412 -I421 0.0614866011882382 G386 -L394 0.0584849305823053 I400 -M405 0.0584571698572116 V412 -Q432 0.058227343268161 G380 -A387 0.0576370970146156 A415 -L434 0.0570534101696534 N384 -G391 0.0555191200935408 A414 -A438 0.052615071272835 D370 -V375 0.0521206350206178 C417 -H427 0.047410144635684 E429 -L434 0.0465358706614518 G374 -G396 0.0436792686269669 I413 -Q437 0.0387880940965981 A415 -Q437 0.038381041211843 I379 -N384 0.0339047952858491 L372 -G386 0.0332565838392043 A414 -H427 0.0320103858375886 L404 -L410 0.0305380119646257 V411 -K430 0.0289062377505318 C417 -Q432 0.0283148544468483 V418 -E426 0.0274717325676042 A389 -M397 0.0263592238706334 A415 -M420 0.0262171180367412 Q432 -A438 0.0259733201365031 I413 -H427 0.024599166835285 F423 -K428 0.0245385764427515 C417 -V425 0.0237523170182241 C417 -L434 0.0210569741432269 T403 -G408 0.0210296224848687 A376 -K395 0.0210058754388287 A371 -A389 0.0202271738699995 G377 -G383 0.0189731246652276 V411 -H427 0.0159813401015123 A415 -F435 0.0132272536659719 V375 -A390 0.0131423364579426 V411 -Q432 0.0114018559710889 G373 -G382 0.0110864078760906 G374 -A381 0.0106253627527697 A376 -V388 0.0100679050884152 G374 -I379 0.0100054632427975 A414 -M420 0.00985368479231674 G374 -K395 0.0083265961769432 F392 -L398 0.00800442317022831 V411 -Q437 0.00756921247511222 G386 -K395 0.00713686760756027 K395 -I400 0.00707355329579595 A389 -K395 0.00616992730446675 L404 -V412 0.00613159003383856 G391 -I400 0.00533753747779464 S416 -H427 0.005035905627093 I378 -A390 0.004683638344676 A415 -F423 0.00348354069958856 V385 -K395 0.00331209686481593 I413 -A438 0.00303958801247731 G373 -I378 0.00280248479403911 A390 -Q401 0.00268171291187058 L398 -L404 0.00267921393557735 I379 -G386 0.00200955875725484 L372 -L393 0.00152886139952813 A371 -G391 0.000683502890997723 G380 -V388 0.000585749064909713 G377 -K395 0.000477407094438442 D370 -A389 -0.000282828723814355 L394 -Q401 -0.000397441054649228 S424 -E429 -0.00263229485538186 E426 -R433 -0.00302613637783122 I413 -E426 -0.00328152977153362 V375 -G382 -0.00387234746381182 I421 -R433 -0.00690865613296299 A414 -E426 -0.00900136507805271 I413 -F435 -0.010069644942746 G383 -A390 -0.0104589611406363 I413 -I421 -0.0107368376975723 L372 -G382 -0.0109797023245424 D370 -G383 -0.0115083952911523 I413 -E436 -0.011660004538661 L372 -G380 -0.0145072429452853 R422 -E429 -0.0150867367209098 I379 -L393 -0.0155893801514182 I413 -R422 -0.0172658162573693 L404 -G409 -0.0174531795152859 V412 -Q437 -0.0176813404813618 G374 -A387 -0.0196792936531538 A390 -I400 -0.0209724839995897 S416 -Q432 -0.0209815342659379 I421 -E429 -0.021198808346381 M405 -A414 -0.0245513184764512 L419 -S424 -0.0248264618284502 L410 -K428 -0.0251084129941388 A387 -I400 -0.0252218440624645 I413 -S424 -0.0253528241365101 G377 -F392 -0.0254404776218271 G380 -A390 -0.0261782149523251 I421 -E431 -0.0272473944893976 L394 -T402 -0.0289759683338233 V388 -L394 -0.0290159527575753 C417 -A438 -0.0291356105807883 H427 -Q432 -0.0292319213790284 L372 -F392 -0.0308218280827548 G377 -L394 -0.0322451510884607 A415 -E436 -0.0322660403648263 G386 -L398 -0.032690855211673 L393 -D399 -0.0345299528263014 A415 -Q432 -0.0361581144934009 A387 -K395 -0.0369620274134226 A387 -D399 -0.0383331287690196 V411 -S424 -0.0394038362278382 A414 -R433 -0.0426893961250132 G391 -Q401 -0.0430126154255008 M405 -I413 -0.0440870173372453 V388 -M397 -0.0449059261137652 V412 -L434 -0.0451850981810322 L372 -K395 -0.0475487720267965 G409 -E431 -0.0475687621314713 L398 -T403 -0.0478524754951799 S424 -E431 -0.0478607592821998 E431 -A438 -0.048107272474557 N384 -A390 -0.0482330284000452 L419 -K428 -0.0494558524195076 A414 -F435 -0.0500364348271445 A371 -G382 -0.0505533862875591 A371 -N384 -0.051656352642002 G383 -F392 -0.0519403813044803 G396 -T402 -0.0531338124725123 A414 -E431 -0.0569344399055136 G373 -F392 -0.0582515131015153 S416 -L434 -0.0596677156620071 A376 -L394 -0.0598022768783526 A371 -G383 -0.0606294207797787 S424 -R433 -0.0644909475938076 D370 -G391 -0.0656753246662163 D370 -V385 -0.0678149353882755 L372 -I379 -0.0722554461826079 G373 -A390 -0.0740116623406467 A414 -E429 -0.0743080781622298 L419 -E426 -0.0771757952968262 L372 -G396 -0.0773345068308826 I379 -F392 -0.0780128045577619 D370 -G386 -0.0782423073609575 A415 -E426 -0.0796870539773362 S416 -F435 -0.0804174722815851 R422 -R433 -0.082923806749496 G377 -A390 -0.0864715013753856 S416 -S424 -0.0864928922965991 A371 -V385 -0.0875006710811248 A415 -E431 -0.0906788326587034 A381 -A387 -0.0926935184552367 I378 -L393 -0.092919797960976 N384 -L393 -0.0929608785161515 I413 -L434 -0.0932182449746766 S416 -V425 -0.0935120156360512 V375 -A381 -0.0946771936757234 I413 -F423 -0.094935877538358 M405 -L410 -0.0966057206929918 A387 -G396 -0.0987000834888794 A414 -Q432 -0.0994532963270585 V385 -G396 -0.10073496910657 I378 -N384 -0.102113702991975 L393 -L398 -0.103087613398714 E426 -E431 -0.104144679514529 A376 -A389 -0.104514253839994 V411 -K428 -0.104540370320231 V385 -L394 -0.105038895550701 I378 -F392 -0.105698708911086 G373 -G386 -0.106189263297935 A414 -L434 -0.107263118610545 A389 -L398 -0.107624102198067 D370 -F392 -0.109287464494455 V375 -G386 -0.112110856279615 S416 -E426 -0.112789169802524 G377 -G386 -0.113019471118682 D370 -V388 -0.113077936957989 A376 -G391 -0.113384106554812 I413 -K430 -0.113585635802821 I378 -G383 -0.114306204053375 R422 -K430 -0.115251249401443 G409 -K428 -0.11707361832915 D370 -G396 -0.119560030201048 I378 -G391 -0.119888853141605 R422 -E431 -0.120955146005393 V375 -N384 -0.121715722933727 L372 -G391 -0.122578895509774 L394 -I400 -0.124363081927316 V385 -L393 -0.125813867841583 F392 -M397 -0.127227058320092 D370 -A376 -0.127614786598952 V388 -D399 -0.128486997622126 G373 -N384 -0.12866335747029 M420 -K428 -0.129152411343395 A376 -L393 -0.131021170799986 I413 -V418 -0.131526283591123 S416 -F423 -0.132756704160588 A415 -R433 -0.136156345537126 M405 -V411 -0.138000884561811 D370 -G377 -0.140111802185868 F423 -R433 -0.141967011583281 L372 -I378 -0.142311497602822 I413 -Q432 -0.143079481614901 A414 -S424 -0.143384702520985 A414 -K430 -0.143432503539466 G373 -A387 -0.147214135337419 V385 -F392 -0.14808768357885 A390 -G396 -0.148739614312518 I421 -K428 -0.149034360221902 G409 -K430 -0.152802110121555 V412 -E429 -0.152899701551126 A371 -I379 -0.153883170994964 F423 -E431 -0.154352594721057 I413 -E429 -0.156725273124402 I379 -V388 -0.159493201223659 E426 -Q432 -0.160240297115381 L372 -G383 -0.160423788523638 L404 -A414 -0.162324152764725 G373 -M397 -0.162621713055526 V375 -G391 -0.1629219663702 E426 -L434 -0.163105119731035 G380 -V385 -0.163516388528394 V375 -F392 -0.163786856974498 R422 -L434 -0.163967409611853 V418 -H427 -0.164291878121659 L419 -H427 -0.165796636796309 A387 -L393 -0.167161103132837 V425 -R433 -0.168401022042155 Q401 -M406 -0.169186346381084 A389 -D399 -0.169651598043047 L419 -V425 -0.170240621699545 V375 -V388 -0.172123691592381 G386 -F392 -0.172316052716444 V412 -E431 -0.172357430140398 D370 -A390 -0.172369316023603 A376 -A381 -0.172734850874932 F423 -E429 -0.173506316242213 A415 -R422 -0.174781741221887 G386 -L393 -0.175236369012944 V412 -E426 -0.177896267426316 G374 -F392 -0.178045627211326 I413 -E431 -0.179180577645955 V418 -R433 -0.180001772974241 A415 -A438 -0.18131645475344 A414 -R422 -0.182934288486825 G377 -V385 -0.183685875009154 G382 -A387 -0.189618199564877 I421 -E426 -0.189889812953845 V411 -E429 -0.191449156072622 K395 -Q401 -0.198541629052968 I378 -G386 -0.198974597634511 V385 -G391 -0.200609965829731 G374 -V388 -0.200645674632181 L372 -G377 -0.201131908809406 N384 -A389 -0.201250175184383 V425 -K430 -0.203466971051697 G386 -M397 -0.2043902986395 V388 -K395 -0.204821278886532 G374 -V385 -0.205120125573137 A376 -N384 -0.20945732537471 A389 -G396 -0.209690791722578 H427 -R433 -0.215072037017211 A390 -L398 -0.218364928907432 V412 -R422 -0.219233224971868 A390 -M397 -0.226082992612637 V412 -K428 -0.231299570525592 L394 -D399 -0.232953861848803 A387 -L398 -0.233382672043868 L410 -K430 -0.233851655839971 V418 -F423 -0.24334553171386 V412 -V425 -0.245632340224601 L372 -A381 -0.247787667906837 A387 -L394 -0.249257585782981 G383 -A389 -0.256331365180457 G380 -G386 -0.259855661708375 C417 -F423 -0.265157800208108 I413 -V425 -0.265159614019325 G374 -A389 -0.27101184716157 G377 -L393 -0.271447907911734 L372 -A387 -0.273707617078995 Q432 -Q437 -0.283817123041941 L372 -A389 -0.303102270630398 A415 -V425 -0.303197669826782 A371 -V388 -0.31094384381105 I413 -K428 -0.320300887328697 A414 -K428 -0.324092534258102 M397 -T402 -0.327400290188261 I379 -A389 -0.334738298993678 M405 -V412 -0.337605392841431 V411 -E431 -0.340435378023175 V418 -V425 -0.344296339580704 C417 -S424 -0.344320069182226 I378 -A389 -0.345213438902675 V418 -S424 -0.364875253833413 M420 -V425 -0.369225739878813 A376 -A387 -0.370725480646999 A415 -I421 -0.386083598316051 F423 -K430 -0.38694024437322 A376 -A390 -0.397337368983517 A371 -A376 -0.406774902249415 I379 -V385 -0.406799586124512 A387 -F392 -0.414354596515963 G386 -G391 -0.414723801286025 G373 -G391 -0.415149403694094 I378 -V385 -0.427808653761217 V388 -L393 -0.446773853146508 V375 -A389 -0.448538874387721 V385 -A390 -0.454673715137754 G391 -G396 -0.456999818918499 G373 -V388 -0.476965480486877 I421 -H427 -0.516786067665396 C417 -R433 -0.525355020812128 C417 -E426 -0.572612922950892