[Mon Aug 29 17:15:42 2016] >Input file: TMQ21T40M3G.pdb >TM segments: 52-90_ 134-147 MAIDEN score = 7.5379 Below is the ranking list of the residue pairs and their related pseudo-energy (the lower, the better). This includes inter-chain residue pairs. The maximum (least favorable) pairwise energy value has been set to 10. See the MAIDEN software article: Postic,G., Ghouzam,Y. and Gelly,J.C. (2015) Biochimie, 115, 155–161. ----------- ---------------- Calpha pair Empirical energy ----------- ---------------- D52 -L58 10 W83 -C90 2.37753359802423 P61 -V67 1.45341489946557 L58 -M70 1.2485525407976 F60 -F68 0.94246608942891 F60 -L137 0.89261044824491 D52 -E59 0.790294520494649 L63 -L137 0.684583626014108 P61 -L137 0.669606565701654 L63 -V136 0.64698444790487 D52 -A71 0.642675576982539 F60 -V67 0.642436834587659 F60 -A138 0.61776838837874 F60 -S69 0.604657108131511 L63 -A138 0.585380198637267 P61 -F68 0.540204682704998 E59 -M70 0.500438781952479 L73 -V78 0.477046847750315 F68 -L137 0.404210781002459 S53 -S69 0.387362417354853 W83 -P134 0.364244487776111 Q57 -E144 0.337517479978124 E59 -G142 0.328426155864203 F60 -G139 0.317820711674187 E59 -S69 0.310263659888336 G66 -S72 0.293665049547413 G66 -G139 0.290557383992715 P61 -S72 0.27367749931944 G54 -S69 0.262288557002003 S69 -L137 0.260753942563239 F68 -G139 0.257564796921564 W56 -G142 0.248778238849168 S69 -A138 0.247561287785064 N81 -C87 0.242455811631234 G54 -S72 0.235577810236126 S69 -K76 0.231265390361783 G62 -S72 0.230711638556061 S53 -M70 0.219046997684488 A84 -S146 0.215552726945123 C87 -G139 0.215374167943017 S72 -V136 0.211688837695734 S69 -V135 0.206204966357658 L73 -V135 0.206070480378569 G66 -P134 0.197503528380312 N81 -G139 0.195269626320193 P61 -P134 0.194928886780916 L58 -G142 0.192814313576319 W56 -S69 0.190172075692259 G62 -L73 0.179014867271993 P77 -P134 0.178355630542201 E59 -V136 0.173413638879278 S53 -V67 0.168343243726225 S53 -R74 0.168074761129789 P61 -G139 0.167393968837024 L63 -V135 0.164191983308497 L79 -P134 0.161217294412444 L80 -C90 0.159571806746013 G62 -A138 0.159393421156233 D64 -V135 0.158586537424808 G66 -V135 0.153462250543487 T85 -G139 0.152387994366004 A84 -C90 0.143368020864936 A71 -V135 0.140276976957437 Q57 -R74 0.1358770218251 N81 -S146 0.133026551043819 G62 -F68 0.132027043883779 L63 -V140 0.129637292379636 W56 -L137 0.128758705702499 G54 -R74 0.123954753556768 P77 -V135 0.123744964217584 Q57 -G139 0.119414683877098 L58 -A138 0.117946823859477 D64 -P134 0.116065905309353 L137 -L145 0.112690690288828 L58 -L80 0.112560870327557 E59 -G65 0.111785468505117 W56 -G139 0.111708043569928 S72 -L137 0.108890902287919 W83 -L137 0.108427033448478 L80 -P134 0.108059314786347 M70 -G139 0.104501237681318 G65 -G139 0.103820711467136 D52 -K76 0.100490716474243 S72 -A138 0.100307361360277 F60 -S146 0.0989024368830389 S69 -L80 0.0963140802124336 A71 -P77 0.0953589063694626 G139 -K147 0.0944575151021218 T85 -V140 0.0935786641755598 L58 -V140 0.0930475637652319 L80 -G139 0.093009427390248 L58 -L79 0.0926864169518593 F82 -L137 0.0902599883464759 K76 -V135 0.0902259440457556 E59 -E144 0.0886070703020233 W83 -S146 0.0856232127930034 G62 -V135 0.0832601467550589 V78 -L137 0.0832113165981374 G66 -L137 0.0807852896043733 N81 -A138 0.0804840957311446 W56 -V67 0.0803732018239049 F60 -F82 0.0801695742249411 L58 -V143 0.078462818588632 F60 -V135 0.0771158122829272 G62 -G142 0.0753455691065763 D52 -V78 0.0741432312524033 S69 -V78 0.0741022161010934 A138 -S146 0.0731194906841113 G62 -P134 0.0709119262872526 D52 -L145 0.0708672400969936 V67 -G139 0.0702657511443388 E59 -L80 0.0697215635650696 D52 -P61 0.067498005780847 A138 -V143 0.0670822227459964 L80 -L145 0.0665593873582906 Q57 -V143 0.0664574074357803 E59 -A71 0.065954883619145 L73 -A138 0.0642274563192231 G62 -T85 0.0617338039129569 L58 -P77 0.0609521415745675 V67 -V140 0.0601906864311399 F68 -L79 0.0593516300265255 F82 -C90 0.0569591100723175 G54 -E59 0.0561088067455704 L58 -V136 0.052791235112287 L58 -S69 0.0517895095582777 G75 -V135 0.051472386390344 G65 -L137 0.0489235117869899 L137 -G142 0.0473308397903374 F68 -L80 0.0471379850054934 Q57 -V67 0.0453287166618692 A84 -V135 0.0452829652106423 A84 -V136 0.0447504522002808 P61 -V140 0.0446428766686586 S53 -L73 0.0441733565674873 L58 -G66 0.0433167725197308 R74 -L79 0.0430618678665322 L63 -T85 0.0428033898519278 G66 -L73 0.0420452845337043 T85 -A138 0.0420428619407982 L58 -S146 0.0407239220748079 Q57 -L137 0.0407114943537987 L73 -L137 0.0391438056187408 G62 -L80 0.0363346443201353 F82 -K147 0.0363248055516072 G66 -A71 0.0356053510283671 G62 -V67 0.0348515607183253 W83 -G142 0.0343715707610392 S69 -G139 0.0339810125315498 A71 -L137 0.0333265460932876 G62 -P141 0.0332246908521023 N81 -P89 0.0327257255411686 R74 -V135 0.0319147463894888 W83 -V136 0.0317044598397391 S69 -G75 0.0314948516291709 W56 -G65 0.0309741703861264 S72 -L79 0.0304095463161644 A84 -G142 0.0293339157960277 L80 -S146 0.0282243191142815 F68 -V78 0.0272230502050266 F82 -P89 0.0266769780558147 P61 -A84 0.026000776775017 A84 -V143 0.0254274329575175 L58 -G75 0.0252272021543134 S53 -S72 0.0251670691928938 E59 -R74 0.0220128060414058 M70 -L79 0.0213364891652033 L80 -V136 0.0212826096569696 W83 -V135 0.0196581537870898 Q57 -A71 0.0196417729169327 E59 -V140 0.0189837864982342 P61 -V135 0.0189610359213424 L79 -V136 0.0179055249632114 D64 -S69 0.0178534146084625 E59 -V135 0.0177106363756381 W56 -S72 0.0168351636879058 F68 -K76 0.0165250730845568 Q57 -P141 0.0157963081758661 F68 -R74 0.0157618071412799 P61 -L145 0.0152505790163229 F60 -P134 0.0144765888481584 Q57 -S146 0.0142558458831061 F60 -A71 0.0134125703632755 V78 -P134 0.0132480203937395 G62 -F82 0.0119824380169691 P61 -L80 0.0105755320574712 G54 -G66 0.00952427383003754 G62 -A84 0.00919529311852596 M70 -A138 0.00685945240111696 V140 -L145 0.0067394140390622 E59 -S146 0.00528477419183182 L58 -E144 0.00451061153535015 G54 -L73 0.00257474961445592 P61 -A138 0.00229361173956599 V67 -S72 0.00229267424500446 D52 -F60 0.00182863615403406 C87 -A138 0.00154671352564861 F82 -P141 -7.17027612828769e-05 L55 -G142 -0.000703054925416779 S69 -L145 -0.000806715402513081 L63 -S72 -0.00085962930586404 S53 -L137 -0.000881192166141138 C90 -P134 -0.00107421100886107 P61 -F82 -0.00122747455533068 L137 -V143 -0.00188544059741691 F60 -P141 -0.00196108256517813 S53 -L58 -0.00210357102484338 G62 -G139 -0.00220024132624777 Q57 -S72 -0.00262971755434949 G75 -L80 -0.00340022574495535 S69 -P77 -0.0047696588399333 P61 -G142 -0.00691651695458784 A71 -V136 -0.00734778418143167 T85 -V136 -0.00855668788026648 A71 -L79 -0.0116084922738242 F82 -E144 -0.013163643601638 L58 -F82 -0.0134023905394738 F82 -V140 -0.0159686775546821 W86 -P141 -0.016296126793263 P77 -V136 -0.0164760533123762 W83 -P88 -0.0167402621137609 F60 -V143 -0.017094231875773 A71 -K76 -0.0173971316094566 G62 -N81 -0.0177713406149316 L80 -A138 -0.0187592171364468 M70 -L80 -0.0188132967334571 F82 -P88 -0.0192733593381225 F60 -W83 -0.0198090065773862 W83 -P141 -0.020520418351107 M70 -V136 -0.021290328529135 R74 -L80 -0.0227864989220778 A84 -P141 -0.0231622666070859 P61 -A71 -0.023292700740992 M70 -V135 -0.0233535865929682 D52 -G75 -0.0239405747655326 G65 -S72 -0.025490922972488 G66 -V140 -0.0255463976266057 F82 -V143 -0.0263477693618881 Q57 -G62 -0.0269849701242461 G65 -P134 -0.0272246485072496 G62 -M70 -0.0272590462478723 D52 -S72 -0.02845159165385 Q57 -G142 -0.0288794358056297 W56 -L145 -0.0295565194588434 S53 -P61 -0.0312768689672955 W86 -V140 -0.0333414493986419 Q57 -S69 -0.0336746283482756 W83 -G139 -0.0337117135323313 S69 -G142 -0.0346028830113001 S53 -G139 -0.0346028830113001 P61 -L73 -0.0356486249775498 D52 -G142 -0.035705290224058 G62 -L137 -0.0365628916266907 G62 -V140 -0.0373220514540975 G62 -A71 -0.0381110639973734 L55 -M70 -0.0386838744712268 G62 -W83 -0.0387107669338583 L55 -S69 -0.0402045035992469 E59 -F68 -0.0402784744291381 S53 -G142 -0.0412121029875718 D64 -V140 -0.0420081699649364 A84 -P134 -0.0461481508479098 G54 -M70 -0.0492289405484829 P61 -V143 -0.050452942052408 Q57 -V140 -0.0505020150564626 L58 -K147 -0.0509895754022969 W83 -L145 -0.0522505403028539 F82 -V135 -0.0548429827139802 L63 -A84 -0.0553271486082307 G65 -V135 -0.0559537078482792 D52 -P77 -0.0585773572306743 Q57 -A138 -0.0589470170896678 C90 -V136 -0.0601352890485742 R74 -L137 -0.0622953822484076 F68 -G75 -0.0640881915690152 S69 -R74 -0.064088854186648 T85 -L137 -0.0668849882877924 W56 -P141 -0.0676882182176994 Q57 -L73 -0.0683333547101464 V78 -V136 -0.0683366068442357 D64 -G139 -0.0689031600624714 G54 -P61 -0.0690786165855059 S53 -F60 -0.0695419430474613 P61 -W83 -0.0699632573743241 W56 -E144 -0.0718564709987461 L55 -G66 -0.0724385959078742 L55 -A71 -0.073352698733796 M70 -G75 -0.0739466628208154 F60 -L80 -0.0740188328722442 A138 -E144 -0.0741483655156374 A84 -G139 -0.0752744890951202 L73 -P134 -0.0756739679264937 E59 -S72 -0.0765038994323759 L137 -S146 -0.0775590089228686 W56 -R74 -0.0776202994124464 A84 -V140 -0.079992610551451 G66 -A138 -0.0807492349468073 D52 -L137 -0.0813491747298387 N81 -V136 -0.081513796972005 A71 -V78 -0.0821757862656192 W56 -P61 -0.0829033386535363 E59 -V67 -0.0834763363389346 D52 -L80 -0.0845371477737941 L63 -F82 -0.0854425634858673 E59 -L73 -0.0859404243424819 L55 -P61 -0.0867598804856682 W56 -A138 -0.0871020371906739 L58 -P141 -0.0871096128627924 E59 -L137 -0.0883936574619346 F82 -S146 -0.0926194723807672 N81 -K147 -0.0926958517134877 F82 -P134 -0.0928683480727299 M70 -L145 -0.0938063609149271 E59 -L145 -0.093875441339776 A138 -L145 -0.09423616337999 P61 -S69 -0.0942635485115583 P61 -M70 -0.0968038426116791 F82 -V136 -0.0969279240752741 G62 -S69 -0.0974069139402903 E59 -A138 -0.0983678455605381 L55 -F68 -0.0984225893084372 L63 -S69 -0.101165743287228 S72 -L80 -0.101233041121991 L58 -G139 -0.102209541448494 L58 -N81 -0.103632542197597 W86 -A138 -0.105009480962777 V67 -V135 -0.105060721453379 D52 -G139 -0.105351999106766 F82 -G139 -0.105588375628415 W56 -V140 -0.105750103475742 F82 -G142 -0.106450323611033 F60 -G65 -0.107407549016573 L58 -V135 -0.108512908820096 G65 -A138 -0.110909705886129 G66 -V136 -0.112013656481385 S53 -F68 -0.11205608722242 W83 -A138 -0.112989982574749 N81 -V135 -0.115017133558324 G54 -F68 -0.115263522764356 L58 -R74 -0.117557675018281 P141 -K147 -0.117762087552448 W83 -P89 -0.118297032390977 A71 -L80 -0.119498745286424 W56 -G66 -0.120931684482646 N81 -L145 -0.123877810535816 G139 -S146 -0.124035058439444 D64 -L137 -0.124774980087751 W56 -L73 -0.125077789622496 A84 -L137 -0.125916752124414 F60 -V78 -0.12694444404554 D52 -V67 -0.126957411122881 V140 -K147 -0.127426394301712 W83 -V140 -0.128033586334472 G65 -V136 -0.128409679059623 T85 -P141 -0.130228271287706 D52 -A138 -0.13175284914756 M70 -V78 -0.132187771256184 F60 -S72 -0.132191906820445 N81 -P88 -0.13284861093568 Q57 -M70 -0.133583342142309 L63 -G139 -0.134242437079544 F82 -L145 -0.134922358931293 W56 -V143 -0.135741801922377 D64 -A138 -0.136081485739621 W56 -A71 -0.136088478091988 S72 -P134 -0.136646121843623 G65 -V140 -0.13689652419544 G139 -L145 -0.137653377864883 G142 -K147 -0.137799560520696 F60 -V140 -0.139408189957759 N81 -C90 -0.140538569829711 F60 -R74 -0.140811236345459 F68 -V140 -0.140882220886581 A84 -P89 -0.141124672790221 S53 -E59 -0.14424351599077 F60 -E144 -0.146933605403821 W83 -V143 -0.147066728007839 F60 -M70 -0.153038974589682 F60 -L145 -0.154917237046773 M70 -P77 -0.155447473233598 M70 -K76 -0.15621656161486 G54 -V67 -0.157428547412152 F82 -A138 -0.157817657761782 F60 -L73 -0.160653514385836 A84 -A138 -0.163460490088659 G54 -F60 -0.163634155616918 L55 -S72 -0.16372480583655 L73 -N81 -0.166736521795216 L73 -V136 -0.167892699504588 F60 -G142 -0.168827207177583 N81 -P134 -0.170486088545691 F68 -P134 -0.172518977878139 E59 -V78 -0.175295765211051 G62 -V136 -0.175346687644781 F68 -V135 -0.177465740870472 D52 -L79 -0.177493277206314 F60 -V136 -0.180246394218107 L55 -F60 -0.181014865692375 S69 -L79 -0.185160163887987 E59 -D64 -0.185628680560925 G139 -E144 -0.187978960716215 L58 -S72 -0.187985060765854 L73 -L80 -0.188128721840688 F68 -V136 -0.188137200039236 D52 -S69 -0.189707030565103 M70 -N81 -0.190818058746241 S53 -L145 -0.191200212659137 W56 -G62 -0.191536497622023 E59 -V143 -0.191837906021531 W86 -G139 -0.193281872419464 F60 -G66 -0.197067222806446 E59 -G66 -0.198066082098109 V67 -L73 -0.200904454126889 L80 -L137 -0.211304426228313 L63 -W83 -0.217253833554641 D52 -Q57 -0.218684539555147 L58 -V78 -0.219715274737192 S72 -P77 -0.22128891234718 L79 -L137 -0.224718532492438 S53 -A71 -0.224791257312722 Q57 -F68 -0.225622037682334 E59 -G139 -0.225838859506851 S69 -V136 -0.226727889939689 L73 -L79 -0.227993237268993 F60 -N81 -0.231829313335175 P61 -P141 -0.239586682764065 D52 -R74 -0.244836869557018 L58 -L73 -0.246496160320344 L58 -V67 -0.248426622792356 F68 -A138 -0.24891006498876 S72 -V78 -0.250351132748935 N81 -L137 -0.250912967362709 L58 -A71 -0.252493201828261 D64 -V136 -0.257657663709933 F68 -L73 -0.259966792487125 E59 -P141 -0.260774190002776 V67 -V136 -0.264447454158883 V140 -S146 -0.264867534999425 L79 -V135 -0.265469354458069 D52 -L73 -0.268042807567598 T85 -C90 -0.272568903025233 V67 -L137 -0.273921602412397 L63 -F68 -0.274041919345063 P61 -V136 -0.274780376642871 D52 -F68 -0.279482061396812 L55 -V67 -0.280709044437948 L58 -L145 -0.28106519968251 R74 -V136 -0.287171978272707 V67 -R74 -0.287704448920269 M70 -L137 -0.287753523623101 L58 -L137 -0.289683901216542 V67 -A138 -0.307941629026014 V78 -V135 -0.316318867595042 L63 -P134 -0.320233262252579 P141 -S146 -0.333883965367874 S72 -V135 -0.34760554401762 D52 -M70 -0.356756005976043 L58 -F68 -0.375166108302535 W56 -M70 -0.397343459351031 L80 -V135 -0.403434668000492 W56 -F68 -0.415406199018884 Q57 -L145 -0.423529612885994 G54 -A71 -0.481559162891087 P61 -G66 -0.567021131432824 F82 -C87 -0.663846861563577